1er mai 1865 : création de la Société Nautique de Besançon par des bisontins soucieux de réunir sous une même bannière les activités corporelles d'agrément, par la pratique du canotage notamment, et les divertissements artistiques par la formation d'une harmonie, d'une chorale et d'un orchestre.
1868 : un quai d'embarquement clos est aménagé sur les rives du Doubs, non loin du pont Bregille.
1884 : construction à Port-Joint du premier hangar destiné à abriter les embarcations
1900 : départ de l’Harmonie Nautique qui faisait partie jusqu'à présent du SNB
1901 : arrêté préfectoral autorisant la société "à naviguer sur le Doubs, avec ses autorisations de course et de promenade ..."
1910 : incendie du club et la reconstruction des bâtiments encore visibles a Port-Joint
1941 : formation d'une section féminine
1955/1960 : la section de Canoë-Kayak qui existait en réalité depuis 1938 se structure réellement. A cette époque, 3 sections sportives sont représentées par le SNB : Aviron, Canoë-Kayak et Natation (jusqu'en 1997).
1997 : départ de la section de natation qui devient l'ANB (Alliance Natation Besançon)
2015 : reprise de la gestion de la piscine du SNB par la Ville de Besançon ainsi que de l'ensemble des locaux.
2016 : départ de la section de canoë-kayak qui devient la Société Nautique Bisontine.
2024 : inauguration des nouveaux locaux du club dans le parc de la friche industrielle de la Rhodiacéta
Championnats de France :
7 médailles de bronze
21 médailles d'argent
16 médailles d'or
Championnats internationaux :
2 bateaux finalistes du Championnat d'Europe
6 participations en Coupe d'Europe
15 participations aux championnats du monde